La première fondation d'une église dédiée aux "santi Ermagora e Fortunato" (san Marcuola) est très ancienne et remonte à la fin du IXème siècle.
Brulée, rebâtie une première fois de style roman,
elle menaçait ruine, lorsqu'il fût décidé de la rebâtir intégralement en 1728 sur des plans de Giorgio Massari.
Les travaux avançaient rapidement, l'intérieur était terminé, lorsqu'en 1736 ils cessèrent brutalement faute de crédits. La façade qui devait recevoir un parement de marbre est restée telle quelle ... comme bien des églises à Venise.